可可碱对人类也有毒性，狗摄入可可碱的 LD₅₀（半数致死量，即摄入后有 50% 死亡的量）为 100–300 mg/kg，猫为 200 mg/kg，而由于人代谢较快，LD₅₀ 为 1000 mg/kg。而且人类的体重更大也更占优势。比如黑巧克力的可可碱含量为 0.5%-1%，牛巧含量更少，白巧几乎不含。就按 1% 的黑巧来算，一个体重 60 公斤的人需要一次性摄入 6 公斤的巧克力才能有 50% 的概率死亡。