加图索的执教生涯始于瑞士锡永队，10场比赛后被解雇。 随后他转战意乙巴勒莫队，同样在6场比赛后被解雇。 2014年12月，他执教克里特岛奥菲队15场比赛仅积14分后辞职。 之后他前往意大利丙级联赛的比萨队，率队获得联赛亚军，并在附加赛中战胜福贾队，帮助这支托斯卡纳球队升入意乙。然而，次年他们再次降级至意丙，最终排名垫底。 2017年11月，他接手AC米兰队，率队获得联赛第六名，并闯入意大利杯决赛，最终负于尤文图斯。次年，他带领AC米兰队获得联赛第五名。 2019年12月，他执教那不勒斯队，率队获得联赛第七名，并赢得意大利杯冠军。次年，他们最终排名第五，无缘欧冠联赛。 2022年，他转会至瓦伦西亚，但在西班牙的经历仅持续了18场比赛。 2023年，他加盟马赛，但同样只执教了16场便告终。 2024-2025赛季，他前往克罗地亚执教哈伊杜克，最终获得联赛第三名。 2025年6月，他接手意大利国家队，主场惨败于挪威，并在世界杯预选赛附加赛中被波黑淘汰。