如果语言同其他生物体一样具有客观实在性，那么不可回避的问题是其进化问题。乔姆斯基在最简方案框架下开始探讨这一问题。

管约论的原则与参数模式为语言习得的逻辑性问题提供了解决方案，接下来要关注语言的进化问题，有学者将其称为进化充分性。语言出现的历史十分短暂，是人类进化过程中近期的产物，在如此短暂的时间里，进化出那么多仅适用于语言的普遍语法原则，是不可思议的。乔姆斯基秉承伽利略-牛顿的研究风格，认为大自然是完美的。语言同样也是一个完美的系统，它的出现和演变必须遵循自然界的一般法则。对应语言的进化问题，有突变论和渐变论两种观点，乔姆斯基旗帜鲜明地支持语言突变论。

语言渐变论深受达尔文生物进化论的影响。达尔文在关注人类进化的同时，对人类语言的独特性产生了浓厚的兴趣，并尝试将语言的这一独特性纳入进化论的研究当中。他的生物进化论对语言学研究者产生了重大的影响。杰肯道夫和平克认为语言是因为交际需求而逐步进化的复杂的适应性结果，在自然选择的随机性方式中，语言机能的后一阶段特征建立在前一阶段特征基础之上，逐渐获得更加完善的体系。这种观点就是语言的渐变观。

但乔姆斯基自始至终都对这一观点表示怀疑，认为语言不可能是自然选择的结果，而将语言的进化归因于基因的突变，是一种功能变异的结果。到目前为止，没有足够证据表明5万年前地球上存在语言。考古学证据表明，语言以及伴随语言的认知现象出现的时间极其短暂，贾雷德·戴蒙德称之为“大跃进”。在某个时刻，大脑发生轻微的重新布线便产生了语言的核心属性：合并。突变是在个体而不是在群体中发生的。个体的基因突变一旦拥有该属性，便有了思想语，从而可以理解、反思、计划等。自此，人类就获得了形成复杂结构即结构性的语言表达式的能力。语言的产生没有外部压力，以这种方式出现的系统是最优的，仅仅由第三要素（即“并非语言器官特有的原则”）的属性决定，如同雪花一样，因此遵循强式最简命题。这种突变可以部分传递给后代，如果具有某些选择性的优势，便可以在小的渔猎社会中扩散。一旦该能力被共享，在某个时刻就会被外化，包括交际。感觉-运动系统在语言出现之前早已存在，完全独立于语言系统且和动物共享。通过合并生成的表达式和感觉-运动系统相连完全是语言外化的结果，语言的外化过程是一个非常复杂的认知任务，是语言习得必须解决的一个重要问题。

简而言之，乔姆斯基的语言进化观认为，合并最初来自生物个体的遗传突变，是人类语言的最初源头，也是造成语言递归的最基本的操作。

——梅德明、佟和龙《什么是最简方案》