【Nature:新突破!超200万单细胞测序绘就炎症性肠病“犯罪地图”】炎症性肠病(IBD)主要包括克罗恩病和溃疡性结肠炎,全球患者超过490万人,仅英国就有50余万。这类疾病反复发作、难以根治,患者往往需要终身服药或多次手术。大量遗传学研究证实,DNA的先天变异在IBD易感性中扮演关键角色,然而超过90%的疾病相关变异位于不编码蛋白质的“非编码区”,令科学家难以厘清它们究竟捣了什么鬼。
发表在国际杂志Nature上题为“Cell-type-resolved genetic variation shapes inflammatory bowel disease risk”的研究报告中,来自威康桑格研究所等机构的科学家们进行了一项里程碑式研究。文章中,他们通过对421名捐赠者(含125名IBD患者)的回肠末端、直肠黏膜及血液样本进行单细胞RNA测序,构建了名为“IBDverse”的超大规模单细胞数据集,覆盖约220万个细胞。在此基础上,研究人员绘制了细胞层面顺式表达数量性状位点(eQTLs)图谱,并将结果与IBD的全基因组关联分析(GWAS)位点进行共定位分析。http://t.cn/AXXHIJhE
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