黄连汤可以看作是为小柴胡汤的变方，小柴胡汤中以桂枝代柴胡，以黄连代黄芩，以干姜代生姜，即为黄连汤。清·柯韵柏说“此亦柴胡加减方也。表无热，腹中痛，故不用柴、芩，君黄连以泻胸中积热，姜、桂以驱胃中寒邪，佐甘、枣以缓腹痛；半夏除呕，人参补虚。虽无寒热往来于外，而有寒热相持于中，仍不离少阳之治法耳。”清·王旭高也说“伤寒分表、里、中三治，表里之邪俱盛，则从中而和之，故有小柴胡汤之和法。至于丹田胸中之邪，则在上下而不在表里，即变柴胡汤为黄连汤，以桂枝易柴胡，以黄连易黄芩，以干姜易生姜，亦从中而和之法。”所谓“从中而和之法”，黄连汤有平调寒热，升降阴阳，和胃降逆的功效。总的说来，小柴胡汤和解表里，黄连汤调和上下。