到达上海后，各地议员云集，准备一同北上参加正式国会，制定宪法，选举总统。宋教仁在上海那几天，神采飞扬，见人便大谈组阁大计。意气风发，像一个即将跨过终点线的长跑者。
黄兴从南京赶来，在上海与宋教仁会面。两人详谈了一次。谈到组阁之后如何推进责任内阁制，如何在议会中建立真正有约束力的审查机制。黄兴说，关键在于财政预算权必须牢牢掌握在国会手里。宋教仁点头，说这正是他看重的一环。
宋教仁于三月二十日乘车北上，黄兴来送行。同行的还有于右任、廖仲恺，还有一些各地赶来的议员和党人。一行人送到上海沪宁车站，月台上灯光昏黄，夜风料峭。众人话别，宋教仁心情极好。与大家一一握手，说了些北上之后再聚的话。转身，走向月台。
枪声响了。共三枪，子弹从右侧腰间射入，穿透膀胱。