北京脑科学与类脑研究所
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【CIBR学术笔记 | 从“混合”到“阵列”:一种更高效的CRISPR文库如何助力帕金森病与朊病毒病研究】

近日,北京脑科学与类脑研究所邀请清华大学基础医学院的尹江安博士开展了一场题为“Quadruple-Guide Arrayed CRISPR Libraries and Novel Genetic Modifiers for Parkinson’s and Prion Diseases”的学术报告。报告由马继延研究员主持。

在脑所的学术报告中,尹江安博士首先介绍了当前常用的 CRISPR 混合文库(CRISPR Pooled Libraries)及其局限性。CRISPR 混合文库是指将靶向不同基因的 sgRNA 混合并包装为慢病毒,并以较低的滴度感染细胞,以保证单个细胞只会被一种慢病毒感染,随后通过深度测序技术揭示基因与细胞生长或药物抗性之间的关系。但 CRISPR 混合文库主要适用于研究细胞自主性(Cell-autonomous)表型,而对于反应细胞的非自主性表型(Non-autonomous phenotypes)并不适用或难以适用,此外,单个 sgRNA 的编辑效率波动较大,在神经退行性疾病研究中,人类遗传多态性的存在也会进一步影响其稳定性和适用性。针对这些问题,尹江安博士构建了一种更高效的,能进行遗传学和表观遗传学功能缺失/获得的 CRISPR 阵列文库(CRISPR arrayed libraries)。

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发布于 北京