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给大家简单介绍下我们团队这项工作，欢迎大家捧场[嘻嘻]！

生物在漫长的进化历史中，总是在反复经历多倍化和二倍化的过程（图8）。二倍化是多倍体进化过程中克服早期基因组冲突、产生新变异并实现适应性的重要阶段，对被子植物的多样化具有关键意义。然而，其节奏和方式长期以来难以厘清。

我们对大米很熟悉，但或许大家不知道的是，稻属一共有26个物种10种基因组类型。也就是说，除了栽培稻，自然界中还有25种野生稻，这其中，有10种野生稻都是四倍体（图9）。

我们选择如今母本（斑点野生稻，基因组类型BB）和父本（药用野生稻，CC）都还现存的小粒野生稻（BBCC）为研究对象，构建了三者高质量的染色体水平基因组（图2）。采用比较基因组学（图2）、形态学、群体遗传学（图3）、基因组序列分析（图4）、转录组学（图5）、DNA 甲基化组学（图6）等方法，主要得到以下结果：

1）小粒野生稻起源于约70万年前，两个亚基因组高度保持与亲本的共线性；
2）基因丢失主要集中发生于二倍化早期；
3）转座子积累和部分同源交换（HE）则是渐进、持续的过程；
4）部分同源基因在不同组织间的表达模式是不一致的，但亚基因组没有表达优势现象；
5）以DNA甲基化、TE分布和亲本遗传对表达式样的影响探讨了TE load假说（基因侧翼区域的TE密度强烈影响表达水平的理论），证明转录调控的复杂性。

我们认为：异源多倍体的二倍化过程既是可以是突发性的，也可以是渐进性的，而不是以往研究将所有证据一概而论。另外，只有进行广泛的群体取样，剔除“亲本遗产”（即双亲遗传变异）干扰后，才能正确解析多倍体自身的进化变化。

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