31個業已公示的古埃及aDNA樣本顯示，Y染色體單倍羣R1b佔據主導地位(52%)，這似乎顯示從史前上埃及前王朝時期的尼羅河西岸Naqada聚落到王朝時期、羅馬時期和拜占庭時期的某些埃及人攜帶的Y染色體單倍羣的遺傳連續性。不過，之前對於實驗室aDNA測序過程中存在污染的學術質疑至今還未有澄清......

值得一提的是，根據埃及阿拉伯籍科學家和研究人員先前於2010年發表的研究報告揭示，阿蒙霍特普三世、阿肯那頓和圖坦卡門的Y染色體單倍羣樣本均為R1b演化分枝。

事實上，Y染色體單倍羣R1b-L20演化分枝並不是後世科普特人之中常見的譜系，即不是從中石器時代的WHG擴散到北非的R1b-V88演化分枝，甚至也不是從原始印歐人(Yamnaya)演化漸變出來的R-L23>R1b-Z2103。這恰恰是西歐Bell Beakers衍生後代的父係譜係。