吴茱萸苦辛性温，功在温中、行气、散寒，止痛，吴朱萸对呕吐吞酸，腹痛痢亦有奇效。已故名医蒲辅周说：“吴茱萸为足二阴经药，宜寒湿痹，通络活血，温中降逆，开郁化滞，润肝燥牌，治酸吐泻.腹痛转筋等.有温热止痛之效。“但究其病机，无非“寒湿”二字，否则不可妄投，明代缪希维在《本草经疏》中所提出的“六不宜用”，颇有见地，其云：“呕吐吞酸属胃火者不宜用；咳逆上气非风寒外邪及冷痰宿水所致者不宜用；腹痛属血虚有火者不宜用；赤白下痢，因邪入于肠胃，而非酒食生冷，停滞积垢者不宜用；小肠疝气，非骤感寒邪及初发者不宜用；霍乱转筋，出于脾胃虚弱暑热所致，而非寒湿生冷干犯肠胃者不宜用：“观此“六不宜用”，吴架萸的适应症，也就显而易见了。同时吴茱萸也常可用于外治法中。中医最擅长外治的吴机师前辈就常外用吴茱萸治疗慢性消化不良，慢性复发性口腔溃疡，以及阴囊湿疹等，