#癌症治疗# 【存放几十年老样本重见天日：科学家研发单细胞DNA测序法，可用于研究存档的癌症样本】

王开乐，是美国#得克萨斯大学# 安德森癌症中心的助理教授。近日，他和合作者研发一款高通量单细胞 DNA 测序方法——“Arc-well”。

这是第一个能对福尔马林固定石蜡包埋（FFPE，Formalin-Fixed Paraffin-Embedded）组织进行测序的方法，能同时对数千个细胞进行基因拷贝数进行分析，填补了利用单细胞 #DNA# 测序对 FFPE 样本进行大规模基因组分析的空白，使得存放几十年的 FFPE 样本得以重见天日。

借助这一方法，该团队针对原发原位导管乳腺癌（DCIS，ductal carcinoma in situ）和复发 DCIS 和浸润性乳腺癌样本进行系统性研究，借此揭示了从原发 DCIS 到复发癌症所遵循的演化模型，为治疗原发 DCIS 提供了重要参考。

从技术层面来讲，Arc-well 方法不仅适用于乳腺癌样本，也适用于其他癌症。该团队利用 Arc-well 对肺癌、前列腺癌、结肠癌、食道癌、卵巢癌等其他多种癌症进行了单细胞 DNA 测序，都获得了非常稳定可靠的结果。

尽管 Arc-well 方法主要针对 FFPE 样本，但其同样适用于新鲜组织和冰冻组织。在新鲜组织和冰冻组织中，由于 DNA 保存得更好、更完整，因此还能检测这些样本中所存在的 DNA 点突变和小的插入缺失等。

当然，Arc-well 也可用于其他不同物种之中，比如常见的模式生物小鼠、大鼠、灵长类等等。经过一定优化，Arc-well 也可以在植物和海洋生物上产生巨大应用前景。另外，还可尝试用于研究博物馆中存放几十年甚至上百年的动物组织样本。

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