二，Y染色體單倍羣C-M130是東亞的一個主要父系譜係，其可能是由最早的定居者&移民浪潮之一所攜帶的高頻譜係，研究者推斷其在東亞的擴散開始於大約40kya，其中C2-M217是分佈最廣的演化分枝，其在華北地區發現頻率較高。迄今為止，發現的最古老的攜帶C2-M217的aDNA樣本的個體是位於黑龍江流域(ARB)的AR19K(19,587-19,175 calBP)。研究者觀察到作為所謂C2-M217的“北部演化分枝”的C2a-L1373和作為所謂C2-M217的“北部演化分枝”的C2b-F1067的分佈模式不同，前者在內蒙古自治區的頻率最高，而後者在中國中部、華北和東北地區頻率最高。具體而言:其一，大多數攜帶C2a譜係的個體可以進一步歸屬於C2a1a，並且它的亞譜係經常在阿爾泰語族羣體中出現。而C2a1a1b1-F1756、C2a1a2a-M86和C2a1a3a-F3796則是中國境內C2a1a攜帶者的主要演化分枝類型。研究者對C2a1a1b1-F1756 的系統發育重建數據表明，它的兩個主要演化分枝可能與蒙古/通古斯語族相關的祖先的早期擴張有關。多項研究亦表明，C2a1a2a亞譜係廣泛存在於東亞和北歐亞的所謂阿爾泰語族羣體，以及以及一些黑龍江流域的祖先型通古斯族羣遷徙到蒙古高原，並將C2a1a2a的遺傳成分傳輸給現代的蒙古語族/突厥語族羣體:其中，C2a1a3a-F3796，也稱為 C2*-Star Cluster，即蒙古語族人羣的創始父系譜系之一，TMRCA的估算時間表明，C2*-ST的傳播模式與蒙古語族羣體的擴張相關，其起源可以追溯到普通的蒙古部落聯盟或者古老的尼倫蒙古氏族。實際上，這些ANA 相關人羣不僅對當今的蒙古語族、通古斯語族和一些突厥語族做出重大遺傳學貢獻，而且由於蒙古帝國的擴張驅動導致在中國中部和南部人羣中亦發現了一些屬於C2a亞譜係攜帶者。其二，研究者對C2b-F1067的系統發育分析表明，攜帶各類C2b亞譜係的古老人羣對現代東歐亞人羣的基因庫做出重大貢獻，數據觀察還表明，內蒙古高原和中國東北地區可能是C2b的初始擴散中心，這與之前的分析發現一致，即華北地區可能是11kya之前的C2b譜係的擴散中心且進而揭示C2b亞譜係的不同地理學分佈模式，比如C2b1a1-CTS2657在華北和東北地區分佈頻率較高、C2b1a2-F3880流行於東北、華北(除內蒙古自治區和山西外)和華東(主要是山東、江蘇和上海)；這其中C2b1b-F845分佈頻率最高的地區是中國中部和西南部(主要是貴州)，以及東南亞地區。尤其重要的是，此項研究和之前的幾項研究都證實C2b1b-F845的南方起源，而此中一項aDNA研究進一步表明，這種父系譜系的起源與南方農業人羣有關，他們將C2b1b的遺傳成分貢獻給蒙古高原的古代游牧羣體。一般來說，基於現代和古代東亞人的遺傳學數據分析表明，新石器時代的蒙古高原狩獵採集者和現代東亞人之間存在牢固的遺傳學聯繫。

三，Y染色體單倍羣D1-M174是早期亞洲父係譜係主要在青藏高原及其周邊地區留下痕跡，安達曼人、與繩文人相關的日本本土人羣和高原藏人之間的古老遺傳學聯繫可以通過共享的源自舊石器時代常染色體祖源成分和單親D譜係得到證實，研究者通過探究D譜系的系統發育地理學起源，發現D1-M174作為東亞人羣的四個主要Y染色體單倍羣之一，顯示出明顯的南方起源:單倍羣D1a在青藏高原和日本列島表現出較高的分佈比率和聚類中心，其中D1a1a亞分枝在中國西南地區的“TB-speaking populations(藏緬語族羣體)”中間出現頻率較高，而在其他中國人羣中間出現頻率較低。前期研究亦表明，在D1-M174向東亞遷徙過程中，其下游演化分枝D1a1a-M15與D1-M174發生分化，隨後D1a1a-M15向北遷徙，經川西到達甘青地區且可能沿藏彝走廊進入喜馬拉雅山脈地區。期間，D1a1b-P99(主要是它的分支D1a1b1-P47)在青藏高原上面與D1-M174分離，這導致D1a1a亞譜係在中國境內廣泛分佈，而D1a1b亞譜係則是西藏人羣特有的最大化父係譜係類型，這通過修訂的Y染色體系統發育、與O譜係的相關性，以及Lubrak-related的D譜係，即高原譜係的相關性，從華北粟農對高原地區的遺傳學貢獻得到了證實。有趣的是，四個譜係，即O2a2b1、O2a2b1a、O2a2b1a1和O2a2b1a1a的頻率也與尼泊爾的“Lubrak-related ancestry”密切相關，這進一步證實新石器時代YRB(黃河流域農民的)擴張促進高原的人羣的繁衍和發展。

四，Y染色體單倍羣N-M231中國最常見的相關父系譜系是其下游演化分枝的N1-CTS3750。遺傳學證據表明，Y染色體單倍羣N-M231可能起源於華南，在更新世晚期至全新世期間，隨著氣候變暖，這些譜係向北擴散至華北和西伯利亞，之後由從西伯利亞南部/所謂內亞沿逆時針路徑向西遷移。之前對西遼河流域6,500ybp至2,700ybp期間的的古代個體進行Y染色體分析發現，單倍羣N-M231是新石器時代中國東北地區最主要的父系譜係，其單倍羣頻率隨著時間的推移逐漸下降。另外，研究者亦發現其下游演化分枝的Y染色體單倍羣N1a-F1206在華北地區表現出相對較高的頻率，而另外一個下游演化分枝的Y染色體單倍羣N1b-F2930則在華南地區表現出相對較高的頻率，特別是在中國西南低海拔地區。先前的另外一項研究結果表明，Y染色體單倍羣N1a和 N1b的差異性分佈模式提供相關證據，即二者的分化可能發生在華北地區，隨後N1a-F1206向北遷徙到東亞以外的地區，而N1b-F2930向南遷徙到華南地區，成為“TB groups(藏緬羣體)”的主要父係譜系，尤其對於彝族而言。令人印象深刻的是，N1a1-M46/Tat是N1a的一個主要演化分枝，其可能起源於東北亞，其一，來自吉林省後套木嘎考古遺址的一個7,430-7,320ybp期間的aDNA樣本屬於N1a1a1a1a-M2117演化分枝，其與新石器時代早期ARB個體，比如DevilsCave_N和Boisman_MN有遺傳學相關性。其二，來自ARB或者黑龍江流域和蒙古高原的幾個青銅和鐵器時代個體攜帶的父係譜係被歸類到N1a或者其下游演化分枝，比如 Yankovsky_IA的aDNA樣本，即I1202/N1a和蒙古高原的鐵器時代早期的EIA_SlabGrave_1的aDNA樣本，即I6365/N1a1a1a1a。此外，Y染色體單倍羣N1a2-F1008/L666是烏拉爾語族羣體的顯性父係類型:來自“Cis-Baikal area”或者貝加爾湖西部區域的新石器時代Shamanka考古遺址的三個aDNA樣本亦屬於N1a2-L666。總而言之，華北和東北西南部可能是N1a2的早期擴散中心，這與之前的觀測結果大體一致。而N1b-F2930主要分佈在中國西南地區的“TB-speaking populations(藏緬語族羣體)”之中，之前所公佈的古代東亞aDNA樣本中沒有單倍羣N1b-F2930出現。