中药烧熏是历代瘟疫预防运用最广泛，也是最重要的手段之一。其特点是起效快，范围广。
“凡瘟疫之流行，皆有秽恶之气”。焚香是古人防疫最简单有效的方法。
香药大都有芳香化湿、通经开窍、芳化和中、清热解毒的功效，用于空气消毒，既能辟秽，又能化湿以消除疫毒。
《本草纲目》中记载，民间百姓在瘟疫流行、或岁旦时用苍术、艾叶烧烟以避邪气的风俗，这是一种行之有效的空气消毒法。
古人烧熏防疫单味药常用艾叶、降香、苍术、红枣、茵陈、大黄等为代表。古籍有很多论述：
“密以艾灸病人床四角，各一壮不得令知之，佳也。断温病，令不相染著。”——晋·葛洪《肘后备急方》
“天时潮蒸，室中宜焚大黄、茵陈之类，亦可以解秽气，或以艾搓为绳点之，亦佳。”——清·王世雄《重订霍乱论》

这一传统沿袭至今，每每在流感爆发之际，众多中医门诊部均以熏艾烟来除秽祛疫。
方法：
病房中央地板上放一个不锈钢碗，放上苍术、艾叶等，倒入少量的95%酒精，点燃（注意防火），熏病房。
划重点：“北大深圳医院”在非典期间3个月里用了850公斤苍术，该院非典期间“无一例院内感染”。
在一些论文里，记载了很多实验数据，证明苍术熏蒸消毒法的消毒效果符合卫生部规定的消毒标准，与紫外线消毒法的结果作对照，发现两种方法效果并无显著差异，而且苍术消毒效果可以持续4小时后。用苍术+艾叶也做了消毒测试，效果跟单用苍术差不多，也很有效。