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22-10-18 09:00 微博认证:上海春谷生物医药科技有限公司

【Cell:开发出更好的方法从海量序列中寻找RNA病毒】一家动物园曾经提供过一本彩色画册,画的是北极熊在冬天的场景,配有各种深浅不一的白色蜡笔。对于在大型数据集中寻找RNA病毒序列的科学家们来说,他们的工作可能类似于在那本书的彩色页面上寻找一片雪花。

在一项新的研究中,来自以色列特拉维夫大学、美国国家生物技术信息中心(NCBI)和美国能源部联合基因组研究所(JGI)的研究人员描述了一个可以专门扫描RNA病毒序列的计算管道。利用这一工作流程,他们梳理了来自世界各地不同环境样本的5000多个RNA序列数据集(宏转录组),使RNA病毒的多样性增加了五倍。相关研究结果于2022年9月28日在线发表在Cell期刊上,论文标题为“Expansion of the global RNA virome reveals diverse clades of bacteriophages”。http://t.cn/A6oMROVg

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