脑膜转移是相对独特的中枢神经系统转移。由于中枢神经系统具有独立的微环境，且与其它系统的免疫微环境存在明显差异，脑膜转移相关肿瘤细胞可能区别于包括原发肿瘤在内的系统肿瘤，而具有独特的分子水平表达特征。以便肿瘤细胞能够进入，并在完全不同的蛛网膜下腔环境中增殖。因此，脑膜转移的治疗应与系统肿瘤区别对待。但同时需要兼顾系统肿瘤情况选择合适的整体与单纯脑膜转移相关治疗方案。
临床中常常遇到具有EGFR/ALK基因突变，并接受有效的靶向药物治疗的非小细胞肺癌，治疗中发生脑膜转移。此时，建议进行全身检查评估，如果没有原发肿瘤或其他中枢神经系统外的肿瘤进展，也就是仅仅发生了脑膜转移。对于此类患者，建议不要轻易更换靶向治疗药物。临床上经常可以看到，由于脑膜转移的发生，盲目采用疗效并不确切的靶向药物，并由于更换了原本对系统肿瘤控制良好的靶向药物，而造成脑膜转移治疗效果不理想，系统肿瘤也出现进展的患者。