疯子人类学从现代活人身上发现尼安德特人基因时就已经破产了，因为基因只能通过生殖遗传，某些现代人身上有尼安德特人基因，就表明几万年前某个晚上，在一个黑漆漆的山洞里，所谓智人和一种被称为尼安德特人的猩猩发生了不正当男女关系。当然，这种关系也可能有一方是被强迫下发生，总之还是发生了，并且生下了后代，这种基因被代代相传至今。

按疯子人类学说法，Y染色体只能父子传承，X染色体是继承父母双方，那么问题来了。如果山洞里的这个尼安德特人是个男性，杂交后生下了儿子，那么Y染色体会变了，以后身上携带尼安德特人基因的男性，Y染色体都不可能是非洲那个叫亚当的猴子的。生下的是女后代，那么X染色体也变了，一天是智人一条是尼安德特人的。如果山洞里的尼安德特人是个女的，以后智人的X染色体也会变了，总之，都不可能再是非洲那个叫夏娃的母猴子独一无二的。

但是疯子人类学的解释，人类只继承了尼安德特人部分基因，Y染色体和X染色体一直保持着纯洁，完整继承非洲一对猴子的，这在遗传学上不可能成立。只要智人在山洞里和尼安德特人发生关系生下后代，就不再纯洁，也可以说都是尼安德特人后代。事实上，中间插进来的不会只有尼安德特人，可以说是多的数不过来。

这种杂交也不可能像人们想象的一样只偶尔发生了一次，跨种杂交最早的后代一般是雌性可育，经过多次回交才有雄性可育的后代，这种过程在现在看来会非常肮脏龌龊不堪，但只有这样才可能出现现在这种结果，不然尼人的基因早就断了。佛经中说人是造孽来的有一定道理，当然，不是所有人祖先都造过这种孽，越是不纯洁的人类，祖上造过孽就越多。